Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF7P17544 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF7P17544 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF7P17544 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF7P17544 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF7P17544 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF7P17544 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF7P17544 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF7P17544 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF7P17544 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF7P17544 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF7P17544 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF7P17544 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF7P17544 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF7P17544 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF7P17544 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF7P17544 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF7P17544 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF7P17544 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF7P17544 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF7P17544 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF7P17544 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF7P17544 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF7P17544 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF7P17544 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF7P17544 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF7P17544 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF7P17544 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF7P17544 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF7P17544 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF7P17544 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF7P17544 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF7P17544 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF7P17544 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF7P17544 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF7P17544 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF7P17544 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF7P17544 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF7P17544 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF7P17544 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF7P17544 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF7P17544 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF7P17544 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF7P17544 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF7P17544 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF7P17544 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF7P17544 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF7P17544 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF7P17544 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF7P17544 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF7P17544 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF7P17544 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF7P17544 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF7P17544 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF7P17544 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF7P17544 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF7P17544 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF7P17544 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF7P17544 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF7P17544 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF7P17544 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF7P17544 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATF7P17544 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATF7P17544 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF7P17544 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF7P17544 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF7P17544 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF7P17544 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF7P17544 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF7P17544 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF7P17544 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF7P17544 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF7P17544 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF7P17544 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF7P17544 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF7P17544 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF7P17544 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF7P17544 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF7P17544 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF7P17544 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF7P17544 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF7P17544 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF7P17544 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF7P17544 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF7P17544 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF7P17544 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF7P17544 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF7P17544 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF7P17544 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF7P17544 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF7P17544 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF7P17544 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF7P17544 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF7P17544 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF7P17544 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF7P17544 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF7P17544 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF7P17544 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF7P17544 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF7P17544 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms