Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF3P15923 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF3P15923 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF3P15923 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF3P15923 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF3P15923 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF3P15923 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF3P15923 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF3P15923 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF3P15923 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF3P15923 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF3P15923 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF3P15923 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF3P15923 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF3P15923 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF3P15923 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF3P15923 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF3P15923 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF3P15923 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF3P15923 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF3P15923 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF3P15923 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF3P15923 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF3P15923 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF3P15923 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF3P15923 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF3P15923 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF3P15923 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF3P15923 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF3P15923 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF3P15923 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF3P15923 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF3P15923 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF3P15923 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF3P15923 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF3P15923 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF3P15923 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF3P15923 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF3P15923 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF3P15923 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF3P15923 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF3P15923 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF3P15923 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF3P15923 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF3P15923 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF3P15923 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF3P15923 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF3P15923 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF3P15923 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF3P15923 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF3P15923 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF3P15923 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF3P15923 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF3P15923 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF3P15923 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF3P15923 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF3P15923 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF3P15923 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF3P15923 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF3P15923 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF3P15923 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF3P15923 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF3P15923 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF3P15923 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF3P15923 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF3P15923 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF3P15923 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF3P15923 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF3P15923 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF3P15923 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF3P15923 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF3P15923 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF3P15923 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCF3P15923 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF3P15923 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF3P15923 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF3P15923 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF3P15923 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF3P15923 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF3P15923 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF3P15923 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF3P15923 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF3P15923 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF3P15923 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF3P15923 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF3P15923 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF3P15923 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF3P15923 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF3P15923 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF3P15923 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF3P15923 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF3P15923 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF3P15923 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF3P15923 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF3P15923 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF3P15923 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF3P15923 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF3P15923 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF3P15923 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF3P15923 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms