Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFAP15692 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms