Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF2RAP15509 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF2RAP15509 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms