Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A3P13637 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms