Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARGP13631 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARGP13631 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARGP13631 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARGP13631 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARGP13631 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARGP13631 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RARGP13631 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARGP13631 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RARGP13631 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RARGP13631 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RARGP13631 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RARGP13631 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RARGP13631 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RARGP13631 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARGP13631 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARGP13631 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARGP13631 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARGP13631 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARGP13631 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARGP13631 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARGP13631 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARGP13631 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARGP13631 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARGP13631 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARGP13631 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARGP13631 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RARGP13631 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RARGP13631 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARGP13631 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARGP13631 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARGP13631 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARGP13631 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARGP13631 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARGP13631 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARGP13631 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARGP13631 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARGP13631 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARGP13631 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARGP13631 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARGP13631 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARGP13631 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RARGP13631 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARGP13631 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARGP13631 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARGP13631 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARGP13631 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARGP13631 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARGP13631 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARGP13631 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARGP13631 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARGP13631 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARGP13631 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARGP13631 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARGP13631 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARGP13631 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARGP13631 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARGP13631 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARGP13631 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARGP13631 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARGP13631 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARGP13631 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARGP13631 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARGP13631 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARGP13631 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARGP13631 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARGP13631 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARGP13631 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARGP13631 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARGP13631 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARGP13631 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARGP13631 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARGP13631 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARGP13631 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARGP13631 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARGP13631 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARGP13631 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARGP13631 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARGP13631 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARGP13631 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARGP13631 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARGP13631 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARGP13631 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARGP13631 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARGP13631 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARGP13631 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARGP13631 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARGP13631 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARGP13631 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARGP13631 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARGP13631 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARGP13631 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARGP13631 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARGP13631 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARGP13631 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARGP13631 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARGP13631 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RARGP13631 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARGP13631 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARGP13631 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms