Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DMDP11532 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMDP11532 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMDP11532 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMDP11532 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMDP11532 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMDP11532 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DMDP11532 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMDP11532 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMDP11532 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMDP11532 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMDP11532 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMDP11532 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMDP11532 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMDP11532 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMDP11532 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DMDP11532 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMDP11532 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMDP11532 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMDP11532 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMDP11532 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMDP11532 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DMDP11532 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DMDP11532 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DMDP11532 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DMDP11532 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DMDP11532 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DMDP11532 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DMDP11532 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DMDP11532 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DMDP11532 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DMDP11532 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DMDP11532 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DMDP11532 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
DMDP11532 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
DMDP11532 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
DMDP11532 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DMDP11532 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DMDP11532 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DMDP11532 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DMDP11532 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DMDP11532 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DMDP11532 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DMDP11532 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DMDP11532 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DMDP11532 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DMDP11532 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DMDP11532 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DMDP11532 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DMDP11532 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DMDP11532 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DMDP11532 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DMDP11532 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DMDP11532 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DMDP11532 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DMDP11532 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DMDP11532 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DMDP11532 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DMDP11532 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DMDP11532 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DMDP11532 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DMDP11532 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DMDP11532 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DMDP11532 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DMDP11532 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DMDP11532 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DMDP11532 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DMDP11532 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DMDP11532 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
DMDP11532 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DMDP11532 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DMDP11532 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DMDP11532 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DMDP11532 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DMDP11532 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DMDP11532 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DMDP11532 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DMDP11532 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DMDP11532 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DMDP11532 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DMDP11532 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DMDP11532 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DMDP11532 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DMDP11532 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DMDP11532 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DMDP11532 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DMDP11532 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DMDP11532 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DMDP11532 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DMDP11532 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DMDP11532 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DMDP11532 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DMDP11532 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DMDP11532 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DMDP11532 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DMDP11532 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DMDP11532 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DMDP11532 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DMDP11532 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DMDP11532 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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