Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NR2F1P10589 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NR2F1P10589 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms