Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRFP10586 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms