Protein–RNA interactions for Protein: P0DP03

IGHV3-30-5, Immunoglobulin heavy variable 3-30-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-5P0DP03 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV3-30-5P0DP03 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV3-30-5P0DP03 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV3-30-5P0DP03 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV3-30-5P0DP03 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-30-5P0DP03 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms