Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CBSLP0DN79 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CBSLP0DN79 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CBSLP0DN79 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CBSLP0DN79 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CBSLP0DN79 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CBSLP0DN79 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CBSLP0DN79 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CBSLP0DN79 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CBSLP0DN79 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CBSLP0DN79 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CBSLP0DN79 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms