Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA6AP0CW24 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA6AP0CW24 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA6AP0CW24 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA6AP0CW24 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA6AP0CW24 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA6AP0CW24 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA6AP0CW24 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA6AP0CW24 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA6AP0CW24 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA6AP0CW24 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA6AP0CW24 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA6AP0CW24 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA6AP0CW24 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA6AP0CW24 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA6AP0CW24 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA6AP0CW24 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms