Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L7P0C7H9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms