Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC36.07■■■■□ 3.37
POLA1P09884 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
POLA1P09884 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
POLA1P09884 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
POLA1P09884 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
POLA1P09884 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
POLA1P09884 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
POLA1P09884 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
POLA1P09884 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
POLA1P09884 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
POLA1P09884 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
POLA1P09884 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
POLA1P09884 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
POLA1P09884 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
POLA1P09884 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
POLA1P09884 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
POLA1P09884 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
POLA1P09884 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
POLA1P09884 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
POLA1P09884 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
POLA1P09884 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
POLA1P09884 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
POLA1P09884 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
POLA1P09884 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
POLA1P09884 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
POLA1P09884 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
POLA1P09884 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
POLA1P09884 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
POLA1P09884 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
POLA1P09884 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
POLA1P09884 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
POLA1P09884 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
POLA1P09884 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
POLA1P09884 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
POLA1P09884 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
POLA1P09884 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
POLA1P09884 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
POLA1P09884 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
POLA1P09884 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
POLA1P09884 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
POLA1P09884 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
POLA1P09884 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
POLA1P09884 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
POLA1P09884 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
POLA1P09884 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
POLA1P09884 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
POLA1P09884 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
POLA1P09884 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
POLA1P09884 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
POLA1P09884 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
POLA1P09884 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
POLA1P09884 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
POLA1P09884 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
POLA1P09884 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
POLA1P09884 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
POLA1P09884 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
POLA1P09884 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
POLA1P09884 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
POLA1P09884 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
POLA1P09884 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
POLA1P09884 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
POLA1P09884 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
POLA1P09884 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
POLA1P09884 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
POLA1P09884 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC36■■■■□ 3.35
POLA1P09884 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
POLA1P09884 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
POLA1P09884 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
POLA1P09884 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
POLA1P09884 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLA1P09884 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLA1P09884 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLA1P09884 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLA1P09884 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLA1P09884 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLA1P09884 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLA1P09884 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLA1P09884 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLA1P09884 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLA1P09884 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLA1P09884 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
POLA1P09884 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLA1P09884 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLA1P09884 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLA1P09884 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLA1P09884 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
POLA1P09884 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLA1P09884 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLA1P09884 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLA1P09884 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
POLA1P09884 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
POLA1P09884 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
POLA1P09884 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
POLA1P09884 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
POLA1P09884 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
POLA1P09884 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
POLA1P09884 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
POLA1P09884 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
POLA1P09884 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
POLA1P09884 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms