Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP1P09874 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP1P09874 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP1P09874 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP1P09874 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP1P09874 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP1P09874 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP1P09874 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP1P09874 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP1P09874 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP1P09874 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP1P09874 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP1P09874 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP1P09874 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP1P09874 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP1P09874 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP1P09874 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP1P09874 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP1P09874 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP1P09874 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP1P09874 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP1P09874 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP1P09874 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP1P09874 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP1P09874 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP1P09874 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP1P09874 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP1P09874 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP1P09874 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP1P09874 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP1P09874 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PARP1P09874 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP1P09874 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP1P09874 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP1P09874 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP1P09874 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP1P09874 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP1P09874 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP1P09874 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP1P09874 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP1P09874 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP1P09874 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP1P09874 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP1P09874 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP1P09874 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP1P09874 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP1P09874 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP1P09874 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP1P09874 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP1P09874 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP1P09874 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP1P09874 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP1P09874 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP1P09874 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP1P09874 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP1P09874 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP1P09874 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP1P09874 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP1P09874 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP1P09874 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP1P09874 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP1P09874 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP1P09874 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP1P09874 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP1P09874 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP1P09874 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP1P09874 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP1P09874 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP1P09874 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP1P09874 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP1P09874 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP1P09874 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP1P09874 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP1P09874 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP1P09874 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP1P09874 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP1P09874 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP1P09874 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP1P09874 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP1P09874 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP1P09874 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP1P09874 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP1P09874 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP1P09874 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP1P09874 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP1P09874 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP1P09874 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP1P09874 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP1P09874 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP1P09874 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP1P09874 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP1P09874 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP1P09874 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP1P09874 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP1P09874 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP1P09874 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP1P09874 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP1P09874 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP1P09874 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP1P09874 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms