Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPRAP08240 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPRAP08240 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPRAP08240 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRAP08240 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRAP08240 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRAP08240 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRAP08240 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRAP08240 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRAP08240 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRAP08240 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRAP08240 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRAP08240 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRAP08240 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRAP08240 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRAP08240 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRAP08240 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRAP08240 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRAP08240 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRAP08240 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPRAP08240 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms