Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LPLP06858 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPLP06858 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPLP06858 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPLP06858 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPLP06858 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPLP06858 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPLP06858 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPLP06858 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPLP06858 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPLP06858 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPLP06858 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPLP06858 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPLP06858 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPLP06858 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPLP06858 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPLP06858 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LPLP06858 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LPLP06858 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LPLP06858 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LPLP06858 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LPLP06858 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LPLP06858 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LPLP06858 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LPLP06858 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LPLP06858 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LPLP06858 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LPLP06858 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LPLP06858 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LPLP06858 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LPLP06858 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LPLP06858 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LPLP06858 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LPLP06858 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LPLP06858 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LPLP06858 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LPLP06858 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LPLP06858 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LPLP06858 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LPLP06858 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LPLP06858 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LPLP06858 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LPLP06858 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LPLP06858 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LPLP06858 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LPLP06858 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LPLP06858 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LPLP06858 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LPLP06858 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LPLP06858 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LPLP06858 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LPLP06858 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LPLP06858 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LPLP06858 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LPLP06858 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LPLP06858 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LPLP06858 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPLP06858 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPLP06858 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPLP06858 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPLP06858 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPLP06858 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPLP06858 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPLP06858 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPLP06858 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPLP06858 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPLP06858 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LPLP06858 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPLP06858 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPLP06858 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPLP06858 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPLP06858 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LPLP06858 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LPLP06858 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LPLP06858 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LPLP06858 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LPLP06858 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LPLP06858 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LPLP06858 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms