Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOA1P02647 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOA1P02647 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOA1P02647 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOA1P02647 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOA1P02647 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOA1P02647 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOA1P02647 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOA1P02647 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOA1P02647 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOA1P02647 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOA1P02647 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOA1P02647 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOA1P02647 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOA1P02647 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOA1P02647 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOA1P02647 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOA1P02647 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOA1P02647 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOA1P02647 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOA1P02647 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOA1P02647 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOA1P02647 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOA1P02647 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOA1P02647 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
APOA1P02647 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOA1P02647 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOA1P02647 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOA1P02647 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOA1P02647 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOA1P02647 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOA1P02647 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOA1P02647 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOA1P02647 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
APOA1P02647 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOA1P02647 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOA1P02647 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOA1P02647 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOA1P02647 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOA1P02647 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOA1P02647 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOA1P02647 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOA1P02647 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOA1P02647 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
APOA1P02647 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOA1P02647 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOA1P02647 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOA1P02647 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOA1P02647 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOA1P02647 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOA1P02647 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOA1P02647 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOA1P02647 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOA1P02647 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOA1P02647 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOA1P02647 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOA1P02647 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOA1P02647 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOA1P02647 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOA1P02647 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOA1P02647 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
APOA1P02647 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOA1P02647 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOA1P02647 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOA1P02647 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOA1P02647 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOA1P02647 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
APOA1P02647 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOA1P02647 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOA1P02647 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOA1P02647 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOA1P02647 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOA1P02647 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOA1P02647 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms