Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV12-3P01733 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms