Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINC1P01008 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINC1P01008 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms