Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD3O95983 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD3O95983 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD3O95983 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD3O95983 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD3O95983 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD3O95983 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD3O95983 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD3O95983 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD3O95983 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD3O95983 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD3O95983 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD3O95983 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD3O95983 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD3O95983 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD3O95983 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD3O95983 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD3O95983 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD3O95983 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD3O95983 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD3O95983 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD3O95983 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD3O95983 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD3O95983 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD3O95983 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD3O95983 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD3O95983 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD3O95983 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD3O95983 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD3O95983 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD3O95983 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD3O95983 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD3O95983 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD3O95983 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD3O95983 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD3O95983 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD3O95983 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD3O95983 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD3O95983 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD3O95983 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD3O95983 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD3O95983 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD3O95983 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD3O95983 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD3O95983 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD3O95983 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD3O95983 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD3O95983 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD3O95983 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD3O95983 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD3O95983 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD3O95983 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD3O95983 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD3O95983 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD3O95983 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD3O95983 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD3O95983 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD3O95983 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD3O95983 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD3O95983 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD3O95983 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD3O95983 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD3O95983 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD3O95983 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD3O95983 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD3O95983 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD3O95983 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD3O95983 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD3O95983 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD3O95983 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD3O95983 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD3O95983 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD3O95983 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD3O95983 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD3O95983 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD3O95983 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD3O95983 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD3O95983 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD3O95983 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD3O95983 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD3O95983 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD3O95983 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD3O95983 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD3O95983 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD3O95983 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD3O95983 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD3O95983 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD3O95983 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD3O95983 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD3O95983 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD3O95983 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD3O95983 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD3O95983 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD3O95983 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD3O95983 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD3O95983 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD3O95983 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD3O95983 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD3O95983 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD3O95983 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms