Protein–RNA interactions for Protein: O95714

HERC2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, humanhuman

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Length 4,834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2O95714 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC2O95714 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC2O95714 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC2O95714 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC2O95714 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC2O95714 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC2O95714 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC2O95714 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC2O95714 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC2O95714 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC2O95714 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC2O95714 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC2O95714 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC2O95714 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC2O95714 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC2O95714 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC2O95714 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC2O95714 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC2O95714 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC2O95714 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC2O95714 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC2O95714 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC2O95714 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC2O95714 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC2O95714 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC2O95714 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC2O95714 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC2O95714 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC2O95714 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC2O95714 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC2O95714 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC2O95714 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC2O95714 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC2O95714 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC2O95714 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC2O95714 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC2O95714 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC2O95714 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC2O95714 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC2O95714 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC2O95714 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC2O95714 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC2O95714 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC2O95714 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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