Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms