Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB11O95342 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ABCB11O95342 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms