Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPBO95292 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPBO95292 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPBO95292 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPBO95292 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPBO95292 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAPBO95292 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAPBO95292 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAPBO95292 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAPBO95292 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAPBO95292 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAPBO95292 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAPBO95292 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAPBO95292 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAPBO95292 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAPBO95292 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAPBO95292 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAPBO95292 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAPBO95292 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAPBO95292 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAPBO95292 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VAPBO95292 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAPBO95292 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VAPBO95292 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAPBO95292 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAPBO95292 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAPBO95292 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VAPBO95292 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VAPBO95292 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VAPBO95292 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VAPBO95292 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAPBO95292 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPBO95292 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPBO95292 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPBO95292 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPBO95292 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPBO95292 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPBO95292 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPBO95292 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPBO95292 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPBO95292 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPBO95292 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPBO95292 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPBO95292 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPBO95292 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPBO95292 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPBO95292 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPBO95292 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPBO95292 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPBO95292 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPBO95292 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPBO95292 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPBO95292 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPBO95292 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPBO95292 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPBO95292 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPBO95292 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPBO95292 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPBO95292 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPBO95292 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPBO95292 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPBO95292 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPBO95292 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPBO95292 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VAPBO95292 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VAPBO95292 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAPBO95292 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAPBO95292 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VAPBO95292 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAPBO95292 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAPBO95292 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VAPBO95292 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAPBO95292 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAPBO95292 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAPBO95292 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAPBO95292 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAPBO95292 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAPBO95292 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAPBO95292 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAPBO95292 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPBO95292 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPBO95292 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPBO95292 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPBO95292 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPBO95292 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPBO95292 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPBO95292 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPBO95292 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPBO95292 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPBO95292 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPBO95292 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPBO95292 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPBO95292 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPBO95292 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPBO95292 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPBO95292 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPBO95292 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPBO95292 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPBO95292 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPBO95292 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms