Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MBD4O95243 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MBD4O95243 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MBD4O95243 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MBD4O95243 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MBD4O95243 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MBD4O95243 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MBD4O95243 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD4O95243 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD4O95243 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD4O95243 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD4O95243 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD4O95243 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD4O95243 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD4O95243 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD4O95243 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD4O95243 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD4O95243 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD4O95243 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD4O95243 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD4O95243 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD4O95243 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD4O95243 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD4O95243 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD4O95243 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD4O95243 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD4O95243 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD4O95243 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD4O95243 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD4O95243 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD4O95243 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD4O95243 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD4O95243 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD4O95243 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD4O95243 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD4O95243 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD4O95243 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD4O95243 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD4O95243 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD4O95243 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD4O95243 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD4O95243 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD4O95243 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD4O95243 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD4O95243 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD4O95243 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD4O95243 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD4O95243 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD4O95243 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD4O95243 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD4O95243 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD4O95243 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD4O95243 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD4O95243 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD4O95243 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD4O95243 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD4O95243 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD4O95243 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD4O95243 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD4O95243 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD4O95243 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD4O95243 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD4O95243 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD4O95243 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD4O95243 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD4O95243 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD4O95243 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD4O95243 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD4O95243 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD4O95243 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD4O95243 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD4O95243 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD4O95243 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD4O95243 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD4O95243 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD4O95243 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD4O95243 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD4O95243 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD4O95243 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD4O95243 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MBD4O95243 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MBD4O95243 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MBD4O95243 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MBD4O95243 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MBD4O95243 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MBD4O95243 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MBD4O95243 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MBD4O95243 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MBD4O95243 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MBD4O95243 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD4O95243 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD4O95243 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD4O95243 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD4O95243 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD4O95243 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD4O95243 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD4O95243 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD4O95243 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD4O95243 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD4O95243 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms