Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms