Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP9AO75110 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms