Protein–RNA interactions for Protein: O60888

CUTA, Protein CutA, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTAO60888 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTAO60888 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTAO60888 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTAO60888 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTAO60888 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTAO60888 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTAO60888 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTAO60888 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTAO60888 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTAO60888 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTAO60888 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTAO60888 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTAO60888 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTAO60888 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTAO60888 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTAO60888 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTAO60888 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTAO60888 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUTAO60888 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUTAO60888 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUTAO60888 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUTAO60888 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUTAO60888 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUTAO60888 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUTAO60888 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUTAO60888 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUTAO60888 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUTAO60888 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUTAO60888 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTAO60888 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTAO60888 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTAO60888 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTAO60888 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTAO60888 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTAO60888 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTAO60888 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTAO60888 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTAO60888 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTAO60888 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTAO60888 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTAO60888 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTAO60888 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTAO60888 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTAO60888 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTAO60888 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTAO60888 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUTAO60888 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUTAO60888 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUTAO60888 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUTAO60888 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUTAO60888 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUTAO60888 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUTAO60888 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUTAO60888 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CUTAO60888 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUTAO60888 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUTAO60888 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUTAO60888 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUTAO60888 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUTAO60888 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUTAO60888 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUTAO60888 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUTAO60888 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUTAO60888 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUTAO60888 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUTAO60888 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUTAO60888 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUTAO60888 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUTAO60888 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUTAO60888 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUTAO60888 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUTAO60888 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUTAO60888 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUTAO60888 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUTAO60888 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUTAO60888 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUTAO60888 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUTAO60888 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CUTAO60888 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUTAO60888 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUTAO60888 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUTAO60888 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUTAO60888 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUTAO60888 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUTAO60888 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUTAO60888 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUTAO60888 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CUTAO60888 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUTAO60888 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUTAO60888 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUTAO60888 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUTAO60888 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUTAO60888 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUTAO60888 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUTAO60888 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUTAO60888 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUTAO60888 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUTAO60888 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUTAO60888 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUTAO60888 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms