Protein–RNA interactions for Protein: O60683

PEX10, Peroxisome biogenesis factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX10O60683 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX10O60683 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX10O60683 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX10O60683 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX10O60683 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX10O60683 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX10O60683 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX10O60683 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX10O60683 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX10O60683 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX10O60683 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX10O60683 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX10O60683 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX10O60683 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX10O60683 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX10O60683 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX10O60683 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX10O60683 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX10O60683 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX10O60683 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX10O60683 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX10O60683 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX10O60683 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX10O60683 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX10O60683 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX10O60683 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX10O60683 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX10O60683 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX10O60683 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX10O60683 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX10O60683 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX10O60683 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX10O60683 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX10O60683 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX10O60683 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX10O60683 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX10O60683 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX10O60683 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX10O60683 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX10O60683 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX10O60683 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX10O60683 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX10O60683 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX10O60683 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX10O60683 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX10O60683 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX10O60683 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX10O60683 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX10O60683 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX10O60683 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX10O60683 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX10O60683 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX10O60683 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX10O60683 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX10O60683 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX10O60683 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX10O60683 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX10O60683 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX10O60683 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX10O60683 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX10O60683 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX10O60683 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX10O60683 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX10O60683 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX10O60683 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX10O60683 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX10O60683 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX10O60683 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX10O60683 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX10O60683 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX10O60683 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX10O60683 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX10O60683 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX10O60683 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX10O60683 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX10O60683 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX10O60683 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX10O60683 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX10O60683 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX10O60683 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX10O60683 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX10O60683 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX10O60683 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX10O60683 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX10O60683 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX10O60683 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX10O60683 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX10O60683 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX10O60683 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX10O60683 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX10O60683 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX10O60683 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX10O60683 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX10O60683 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX10O60683 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX10O60683 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX10O60683 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX10O60683 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX10O60683 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX10O60683 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms