Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNT1O60563 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNT1O60563 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNT1O60563 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNT1O60563 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNT1O60563 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNT1O60563 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNT1O60563 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNT1O60563 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNT1O60563 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNT1O60563 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNT1O60563 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNT1O60563 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNT1O60563 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNT1O60563 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNT1O60563 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms