Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM3APO60318 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms