Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
KIAA0556O60303 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KIAA0556O60303 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms