Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN6O43657 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN6O43657 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN6O43657 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN6O43657 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN6O43657 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN6O43657 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN6O43657 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN6O43657 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN6O43657 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN6O43657 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN6O43657 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN6O43657 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN6O43657 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN6O43657 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN6O43657 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN6O43657 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN6O43657 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN6O43657 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN6O43657 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN6O43657 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN6O43657 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN6O43657 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN6O43657 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN6O43657 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN6O43657 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN6O43657 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN6O43657 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN6O43657 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN6O43657 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN6O43657 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN6O43657 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN6O43657 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN6O43657 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN6O43657 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN6O43657 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN6O43657 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN6O43657 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN6O43657 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN6O43657 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN6O43657 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN6O43657 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN6O43657 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN6O43657 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN6O43657 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN6O43657 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN6O43657 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN6O43657 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN6O43657 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN6O43657 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN6O43657 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN6O43657 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN6O43657 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN6O43657 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN6O43657 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN6O43657 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN6O43657 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN6O43657 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN6O43657 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN6O43657 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN6O43657 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN6O43657 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN6O43657 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN6O43657 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN6O43657 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN6O43657 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN6O43657 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN6O43657 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN6O43657 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN6O43657 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms