Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT7O43581 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT7O43581 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT7O43581 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT7O43581 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT7O43581 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT7O43581 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT7O43581 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT7O43581 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT7O43581 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT7O43581 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT7O43581 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT7O43581 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT7O43581 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT7O43581 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT7O43581 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT7O43581 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT7O43581 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT7O43581 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT7O43581 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT7O43581 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT7O43581 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT7O43581 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT7O43581 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT7O43581 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT7O43581 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT7O43581 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT7O43581 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT7O43581 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT7O43581 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT7O43581 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT7O43581 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT7O43581 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT7O43581 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT7O43581 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT7O43581 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT7O43581 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT7O43581 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT7O43581 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT7O43581 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT7O43581 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT7O43581 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT7O43581 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYT7O43581 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYT7O43581 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYT7O43581 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYT7O43581 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT7O43581 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT7O43581 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT7O43581 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT7O43581 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT7O43581 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT7O43581 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT7O43581 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT7O43581 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT7O43581 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT7O43581 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT7O43581 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT7O43581 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT7O43581 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT7O43581 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT7O43581 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT7O43581 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT7O43581 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT7O43581 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT7O43581 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT7O43581 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT7O43581 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT7O43581 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT7O43581 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT7O43581 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT7O43581 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT7O43581 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT7O43581 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT7O43581 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT7O43581 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT7O43581 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT7O43581 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT7O43581 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT7O43581 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT7O43581 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT7O43581 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT7O43581 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT7O43581 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT7O43581 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT7O43581 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT7O43581 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT7O43581 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT7O43581 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT7O43581 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT7O43581 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT7O43581 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT7O43581 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT7O43581 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT7O43581 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT7O43581 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT7O43581 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT7O43581 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT7O43581 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT7O43581 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms