Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF3O43395 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms