Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCP110O43303 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCP110O43303 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCP110O43303 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCP110O43303 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCP110O43303 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCP110O43303 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCP110O43303 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCP110O43303 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCP110O43303 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCP110O43303 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCP110O43303 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCP110O43303 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCP110O43303 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCP110O43303 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCP110O43303 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCP110O43303 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCP110O43303 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCP110O43303 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCP110O43303 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCP110O43303 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCP110O43303 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCP110O43303 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCP110O43303 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCP110O43303 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCP110O43303 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCP110O43303 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCP110O43303 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCP110O43303 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCP110O43303 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCP110O43303 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCP110O43303 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCP110O43303 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCP110O43303 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCP110O43303 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCP110O43303 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCP110O43303 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCP110O43303 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCP110O43303 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCP110O43303 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCP110O43303 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCP110O43303 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCP110O43303 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCP110O43303 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCP110O43303 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCP110O43303 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCP110O43303 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCP110O43303 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCP110O43303 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCP110O43303 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCP110O43303 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCP110O43303 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCP110O43303 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCP110O43303 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCP110O43303 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCP110O43303 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCP110O43303 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCP110O43303 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCP110O43303 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCP110O43303 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCP110O43303 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCP110O43303 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCP110O43303 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCP110O43303 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCP110O43303 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCP110O43303 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCP110O43303 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCP110O43303 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCP110O43303 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCP110O43303 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCP110O43303 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCP110O43303 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCP110O43303 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCP110O43303 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCP110O43303 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCP110O43303 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCP110O43303 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCP110O43303 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCP110O43303 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCP110O43303 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCP110O43303 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCP110O43303 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCP110O43303 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCP110O43303 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCP110O43303 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCP110O43303 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCP110O43303 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCP110O43303 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCP110O43303 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCP110O43303 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCP110O43303 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCP110O43303 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCP110O43303 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCP110O43303 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCP110O43303 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCP110O43303 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCP110O43303 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCP110O43303 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCP110O43303 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCP110O43303 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms