Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNPHO15079 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNPHO15079 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNPHO15079 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNPHO15079 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNPHO15079 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNPHO15079 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNPHO15079 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNPHO15079 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNPHO15079 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNPHO15079 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNPHO15079 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNPHO15079 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNPHO15079 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNPHO15079 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNPHO15079 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNPHO15079 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNPHO15079 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNPHO15079 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNPHO15079 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNPHO15079 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNPHO15079 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNPHO15079 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNPHO15079 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNPHO15079 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNPHO15079 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNPHO15079 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNPHO15079 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNPHO15079 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNPHO15079 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNPHO15079 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNPHO15079 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNPHO15079 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNPHO15079 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNPHO15079 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNPHO15079 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNPHO15079 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SNPHO15079 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNPHO15079 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNPHO15079 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNPHO15079 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNPHO15079 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNPHO15079 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNPHO15079 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNPHO15079 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNPHO15079 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNPHO15079 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNPHO15079 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNPHO15079 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNPHO15079 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNPHO15079 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNPHO15079 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNPHO15079 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNPHO15079 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNPHO15079 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNPHO15079 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNPHO15079 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNPHO15079 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNPHO15079 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNPHO15079 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNPHO15079 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNPHO15079 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNPHO15079 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNPHO15079 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNPHO15079 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNPHO15079 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNPHO15079 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNPHO15079 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNPHO15079 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNPHO15079 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNPHO15079 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SNPHO15079 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNPHO15079 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNPHO15079 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNPHO15079 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNPHO15079 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNPHO15079 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNPHO15079 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNPHO15079 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNPHO15079 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNPHO15079 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNPHO15079 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNPHO15079 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNPHO15079 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNPHO15079 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNPHO15079 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNPHO15079 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNPHO15079 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNPHO15079 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNPHO15079 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNPHO15079 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNPHO15079 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNPHO15079 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNPHO15079 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNPHO15079 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SNPHO15079 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNPHO15079 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNPHO15079 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNPHO15079 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNPHO15079 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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