Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCF2LO15068 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCF2LO15068 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms