Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLGNO14967 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLGNO14967 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLGNO14967 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLGNO14967 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLGNO14967 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLGNO14967 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLGNO14967 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLGNO14967 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLGNO14967 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLGNO14967 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLGNO14967 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLGNO14967 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLGNO14967 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLGNO14967 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLGNO14967 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLGNO14967 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLGNO14967 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLGNO14967 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLGNO14967 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLGNO14967 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLGNO14967 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLGNO14967 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLGNO14967 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLGNO14967 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLGNO14967 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLGNO14967 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLGNO14967 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLGNO14967 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CLGNO14967 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLGNO14967 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLGNO14967 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLGNO14967 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLGNO14967 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLGNO14967 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLGNO14967 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLGNO14967 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLGNO14967 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLGNO14967 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLGNO14967 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLGNO14967 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLGNO14967 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLGNO14967 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLGNO14967 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLGNO14967 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLGNO14967 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLGNO14967 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLGNO14967 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLGNO14967 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLGNO14967 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLGNO14967 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLGNO14967 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLGNO14967 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLGNO14967 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLGNO14967 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLGNO14967 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLGNO14967 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLGNO14967 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLGNO14967 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLGNO14967 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLGNO14967 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLGNO14967 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLGNO14967 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLGNO14967 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLGNO14967 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLGNO14967 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLGNO14967 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLGNO14967 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLGNO14967 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLGNO14967 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLGNO14967 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLGNO14967 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLGNO14967 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLGNO14967 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLGNO14967 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLGNO14967 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLGNO14967 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLGNO14967 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLGNO14967 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLGNO14967 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLGNO14967 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLGNO14967 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLGNO14967 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLGNO14967 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLGNO14967 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLGNO14967 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLGNO14967 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLGNO14967 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLGNO14967 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLGNO14967 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CLGNO14967 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLGNO14967 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLGNO14967 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLGNO14967 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLGNO14967 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLGNO14967 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLGNO14967 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLGNO14967 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLGNO14967 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLGNO14967 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms