Protein–RNA interactions for Protein: O14770

MEIS2, Homeobox protein Meis2, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS2O14770 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS2O14770 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS2O14770 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms