Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE40O14503 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms