Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KPNA3O00505 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPNA3O00505 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms