Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3C2AO00443 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3C2AO00443 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms