Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC188H7C350 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC188H7C350 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms