Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRRT4C9JH25 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRT4C9JH25 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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