Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms