Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YJEFN3A6XGL0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms