Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SERINC4A6NH21 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms