Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PGPEP1LA6NFU8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGPEP1LA6NFU8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms